对于想接受质子治疗的鼻咽癌患者来说，除了治疗效果外，最关心的问题就是治疗费用。
　　 国内比较主流的质子治疗机构——上海质子重离子医院的医疗程治疗费用为27.8万人民币，加上住院、检查、用药等，总费用大概在35-40万人民币左右。目前，我国质子治疗费用还不能医保报销，需要患者个人承担。
　　 国际上质子治疗比较发达的国家主要是德国、日本和美国，这三国在质子治疗费用上的差距非常大。美国按次收费，一般治疗完成在12-15万美元，约折合人民币90万元左右；德国在5-6万欧元，约人民币40万左右；最低的是日本在300万日圆之下，相当于18万人民币左右。总体来说，日本最低，德国价位适中，美国是德国的2-3倍左右。
　　 对于出国质子治疗的患者来说，除了治疗费，还要考虑生活费、交通费等费用，加上这些，美国质子治疗的总费用轻松突破百万人民币，德国在60-70万人民币左右，日本在35-40万人民币左右。日本的总费用居然和国内的治疗费用持平，其实在实际的治疗案例中，不乏日本的质子治疗总费用比上海更低的患者案例。
　　日本的质子治疗费用为什么这么低？日本质子治疗领域比较有名的机构,大多是老牌质子治疗机构、“公立”机构。以日本质子治疗机构的代表——日本国立癌症研究中心东病院（国癌东院）为例，国癌东院是日本第一家引进质子设备、全球第二家开展临床应用的医院。这种“公立”机构，享有国家扶持，治疗费用普遍较低。国癌东院，几乎是日本质子治疗费用最低的机构之一，此外，日本筑波大学附属医院质子中心、日本相泽病院等质子治疗机构的质子治疗费用比不是很高。
　　 良好的医疗服务环境、有保障的医疗治疗效果，加上比国内还低的治疗费用，让日本质子机构成为国内鼻咽癌质子治疗患者优先考虑的选择之一。